南通违章查询的方式有以下几种：

1. 登陆交警网查询：打开南通交警网官网，点击“机动车违法查询”，输入车辆的车牌号和车辆识别码（也叫车架号），再点击查询，即可看到该车辆的违章情况。

2. 微信公众号查询：打开微信，搜索并关注“南通交警”公众号，然后在公众号下方的菜单中点击“交通出行”，再点击“交通违法”，输入车牌号码和车辆识别码等信息，即可查询到车辆的违章情况。

3. 线下查询：携带相关证件资料，如身份证、驾驶证、行驶证等，到南通市交通警察支队办公大厅或各交警大队办公大厅进行查询。如果是代他人查询车辆违章情况，还需带上代理人的有效身份证件。

此外，还可以通过APP查询、银行网点查询等方式进行查询。建议根据自己的实际情况选择适合的查询方式。如果查询到有违章情况，请及时按规定处理，避免影响车辆的正常使用。